เมื่อ "ไซเรน" กองกำลังเอเลี่ยนที่มีคลังแสงเกินขีดจำกัดของเทคโนโลยีในปัจจุบัน ปรากฏขึ้นอย่างกะทันหัน มนุษยชาติที่ถูกแบ่งแยกได้ยืนหยัดในความเป็นน้ำหนึ่งใจเดียวกันอย่างสมบูรณ์เป็นครั้งแรก สี่ประเทศก่อตั้ง Azur Lane ปูทางสำหรับการปรับปรุงการทำสงครามสมัยใหม่ ซึ่งนำไปสู่ชัยชนะในขั้นต้น อย่างไรก็ตาม สหภาพที่อ่อนแอนี้ถูกคุกคามโดยอุดมการณ์ที่ต่อต้าน แบ่งพันธมิตรออกเป็นสองส่วน และมนุษยชาติก็แตกแยกอีกครั้ง
ในฐานะนักสู้ที่ช่ำชองและมีประสบการณ์ Enterprise "Grey Ghost" แบกรับความหวังของ Azur Lane ในการยุติสงคราม แต่เบื้องหลังบุคลิกที่อดทนของเธอกลับซ่อนเด็กสาวที่อ่อนแอ กลัวมหาสมุทร ถึงกระนั้น เธอยังคงต่อสู้ต่อไปโดยเชื่อว่ามันเป็นจุดประสงค์เดียวสำหรับการดำรงอยู่ของเธอ
ท่ามกลางความขัดแย้งที่ไม่มีวันสิ้นสุดในมนุษยชาติ กุญแจที่สามารถรวมเผ่าพันธุ์ที่กระจัดกระจายอาจมีอยู่: ทหารที่ตกลงกับบุคลิกลึกลับและความสนิทสนมของเธอระหว่างผู้ที่มีอุดมการณ์ต่างกัน